秦朝的中央行政機關實行三公九卿制。
　　皇帝之下設三公，三公為：
　　（1）丞相：承受皇帝之命，輔助皇帝掌管天下的行政的官；
　　（2）太尉：掌管軍事的最高官吏；
　　（3）御史大夫：主要管理記事，其地位相當于副丞相，主要職責是管理圖籍、奏章，監(jiān)察文武百官。
　　御史大夫下設御史中丞，掌管圖書秘籍，同時監(jiān)察文武官吏；
　　侍御史，掌管文書；
　　監(jiān)御史，中央派到地方各郡負責監(jiān)督郡守的御史。
　　三公之下設九卿，作為中央行政機關分掌具體行政事務，如祭祀、禮儀、軍事、行政、司法、文化教育等。
　　包括：
　　（1）奉常：掌管宗廟禮儀，地位很高，屬九卿之首；
　　（2）郎中令：掌管宮殿警衛(wèi)；
　　（3）衛(wèi)尉：掌管宮門警衛(wèi)；
　　（4）太仆：掌管宮廷御馬和國家馬政；
　　（5）廷尉：掌管司法審判；
　　（6）典客：掌管外交和民族事務；
　　（7）宗正：掌管皇族、宗室事務；
　　（8）治粟內(nèi)史：掌管租稅錢谷和財政收支；
　　（9）少府：掌管專供皇室需用的山海池澤之稅。
　　丞相下設中尉，九卿（即：衛(wèi)尉，郎中令，太仆，廷尉，典客，奉常，宗正，少府，治粟內(nèi)史）并管理下屬各郡。